Suivant son régime fiscal, une entreprise aura des obligations comptables variables. En particulier, le mode de comptabilisation des pièces comptables suivra des règles différentes :
 En comptabilité sur les encaissements : comptabilité des entreprises relevant du régime de la déclaration contrôlée des BNC.
 En comptabilité de trésorerie : acceptée pour les entreprises relevant des BIC, soumises au régime réel simplifié et qui optent pour une comptabilité super-simplifiée.
 En comptabilité sur les débits : imposée pour les entreprises qui relèvent des BIC, au régime réel simplifié (sans option pour une comptabilité super-simplifiée) ou réel normal.